南京商业学校建有财经系、信息工程系、国际贸易系、旅游管理系、汽车服务系和国际教育学院5系1院。师资力量雄厚,拥有“国家级烹饪大师”、江苏省“六大人才高峰”高层次人才、江苏省“333”高层次人才、江苏省职业教育领军人才、江苏省特级教师、教授、市区学科带头人、市区优秀青年教师等名师团队近百人。学校的会计、烹饪、物流三个专业教师团队均为南京市“优秀教学团队”。拥有物流服务与管理、中餐烹饪、计算机网络技术三大“江苏省现代化专业群”,会计、烹饪、物流、电子商务、酒店、汽修、计算机网络技术七大“江苏省品牌专业”。烹饪、会计等一批“国家级实训基地”、“江苏省高水平现代化实训基地”。
南京商业学校注重学生的全面发展,校园生活丰富多彩,100多个精品社团为学生提供了广阔的舞台,多个项目在国际、全国重要赛事中获得优异成绩。
南京商业学校在各级技能大赛中先后获得12块国赛金牌,89块省赛金牌,100多名金牌学生被保送到南京航空航天大学、南京财经大学、南京艺术学院、扬州大学、金陵科技学院、南京晓庄学院等高校本科深造。学校连续5年毕业生就业质量跟踪调查名列南京市区第一名。
南京商业学校广泛开展国际交流与合作,与美国、加拿大、英国、澳大利亚共同开设中美国际商务班、中加艺术高中班、中英HND班等项目。学校注重校企合作,与中国动漫集团挂牌成立“中国动漫集团南京文化创意学院”,与联想集团挂牌成立“联想学院”,与京东企业共建“京东校园双创实训孵化基地”、“京东校园馆”等。